日本所说的“同人(doujin)”游戏有两个完全不同的概念，一种是“非官方”，一种是“独立”。
“非官方”就是指的未经官方授权的有ip作品。
“独立”指的是个人小团体没有商业投资自己开发的作品，比如《洞窟物语》《东方Project》系列。
不光游戏，其他音乐、文学、画集等也是一样，都是来源于同人作品交流会或者漫展上自己贩卖的东西。

楼主说的同人是指楼上说的官方还是非官方呢，如果是官方那就太多了

楼主说的《羊村大崩坏》是RPG Maker做的喜羊羊灰太狼的非官方恐怖游戏。《野比大雄的生化危机》也属于此类不过比羊村那个好太多了。
洛克人系列有很多不错的同人作品，比如《洛克人无限》《RnR》等等，还有后来被官方收编的《洛克人x街霸》。
让我最震撼的同人作品是《AM2R》非官方的《密特罗德2》重制版。

我觉得很厉害的同人是古墓丽影的自制关卡 但是只是云了

我想起了橙光游戏的潜伏之赤途，真的是很经典的作品，推荐给没玩过的人玩一下，而且steam上面还有根据这个游戏全新做了个游戏，叫隐形守护者

我只玩过各种曹操传的mod，很多。
不过那个好像不算同人…………

我玩过的同人游戏有马里奥的MF、SMBX、一堆SMW改版、NSMBDS对战版等，还有索尼克的S3AIR、SRB2等。

想来窝玩过的同人游戏主要都是flash(不止是网页的)，而且洛克人主题的比较多，再就是拳皇主题和其它
再就是mugen了

红警2的各种mod巨多

最有名的同人游戏就是《野比大雄的生化危机》了，甚至你百度野比大雄搜出来的都不是官方那个野比大雄而是它

你看这个算不，刚开始玩，轩辕剑素材拼凑的原创rpg